La création du Pôle de Recherche et d’Enseignement Supérieur Université de Bordeaux répond à une volonté forte de ses membres fondateurs et de ses membres associés de travailler ensemble de manière à rendre le site universitaire bordelais

• plus lisible,
• plus attractif,
• plus compétitif,

dans les domaines de l’enseignement supérieur et de la vie étudiante, de la recherche et de la gestion des moyens et des équipements du site.

Le président de l’Université de Bordeaux est Jean-Pierre LABORDE, également président de l'Université Montesquieu - Bordeaux IV.
Le vice-président est Manuel TUNON de LARA, actuel président de l'université Victor Segalen Bordeaux 2.